DNA-analyysejä tarvitaan periytyvien tautien diagnostiikassa

DNA-analyysejä tarvitaan periytyvien
tautien diagnostiikassa

Ihmisen peritty tai hankittu muutos yhdesä geenissä, jopa yhden DNA:n emäksen muuttuminen toiseksi, voi muuttaa proteiinin ominaisuuksia. Tämä puolestaan ilmenee pieninä tai suurina muutoksina ihmisen aineenvaihdunnassa ja aiheuttaa taudin. Kun ihmisen perinnöllisen taudin aiheuttava geenivirhe tunnetaan, sen osoittamista DNA-analyysin avulla voidaan hyödyntää diagnostiikassa. Tällaisen diagnoosin suurin etu onkin taudin paljastuminen aikaisessa vaiheessa, vaikka oireita ei vielä esiintyisikään, ja vaikkei elimistöstä voitaisi mitata virheellisen geenin koodittamaa virheellistä proteiinia.

DNA-analyysit tarjoavat paitsi tautien tarkan diagnoosin myös mahdollisuuden alkio- ja sikiödiagnostiikkaan sekä oireettomien taudinkantajien tunnistamiseen. DNA-diagnostiikan avulla voidaan analysoida vain etukäteen määriteltyä geeniä tai geenejä ja analyysin tulos antaa vastauksen ainoastaan siinä esiintyvistä muutoksista.

DNA:n monistusmenetelmä, PCR-tekniikka, jonka avulla monistetaan koeputkessa haluttu DNA-alue jopa miljoonakertaiseksi käyttämällä lyhyitä DNA-palasia (alukkeita) ja lämmönkestävää DNA-polymeraasientsyymiä, on merkittävästi parantanut DNA-diagnostiikan mahdollisuuksia. Yleisimmin PCR-tekniikan avulla tautigeeni monistetaan pienestä verinäytteestä, mutta se voidaan tehdä myös kudoksista, syljestä tai jopa yhdestä hiuksesta.

Tehokas PCR-tekniikka

Perinnöllisten tautien diagnostiikassa osoitetaan muutoksia tietyssä ihmisen geenissä. Tauteja aiheuttavat mutaatiot voivat olla laajoja perimän uudelleen järjestäytymiä, jotka on teknisesti helpompi osoittaa kuin suurimman osan taudeista aiheuttavat pistemutaatiot, yhden tai muutaman emäksen geenivirheet. PCR-tekniikan avulla yksi virheellinen emäs ihmisen perimän 4 miljardin emäksen joukosta voidaan tunnistaa jopa yhdestä ainoasta solusta. Sen ansiosta voidaan kehittää luotettavia ja teknisesti yksinkertaisia, kliinisiin rutiinilaboratorioihin soveltuvia DNA-testejä, esimerkkinä Suomessa kehitetty minisekvensointitekniikka pistemutaatioiden osoittamiseksi.

AGU-tautia kantaa joka 50.

Eniten kokemusta KTL:n lääketieteellisen molekyyligenetiikan osastolle on kertynyt suomalaisen AGU-taudin diagnostiikasta. Turun yliopiston kanssa on minisekvensointimenetelmää käyttäen selvitetty, että AGU-taudin aiheuttaa sama mutaatio lähes kaikissa suomalaispotilaissa.

toisen palstan alkuun

Muutamia sikiödiagnooseja on tehty AGU-perheissä. Nyt on selvitetty, että noin joka 50. suomalainen on AGU-taudin kantaja. Tässä hankkeessa minisekvenssointimenetelmä osoittautui tehokkaaksi myös suurten näytemäärien analysoinnissa. Parhaillaan on käynnissä Suomen ensimmäinen laaja kantajakartoitus, jossa AGU-mutaation testiä tarjotaan 2 000 äitiysneuvolan asiakkaalle Helsingin alueella.

Muiden suomalaisen tautiperinnön geeenivirheiden selvittyä tavoitteena on kehittää DNA-testipaneli, jonka avulla näiden tautien kantajat voidaan tunnistaa. On arvioitu, että joka viides suomalainen kantaa jotakin suomalaiseen tautiperintöön kuuluvaa geeniä. Väestökartoituksen avulla voitaisiin tunnistaa pariskunnat, joissa kumpikin kantaa samaa tautigeeniä ja joilla on riski saada sairas lapsi. Vanhemmat voisivat päättää perhesuunnittelun tai sikiödiagnostiikan avulla haluavatko he sairaan lapsen syntyvän.

Ihmisen perimän kartoitusprojektin edetessä tiedot perinnöllisten tautien takana olevista geenivirheistä lisääntyvät. Monimutkaisempien usean geenin ja ympäristön tai elintapojen yhteisvaikutuksesta syntyvien tautien ymmärtämys lisääntyy nopeasti. Yksilön perinnöllisen alttiuden suuruutta sairastua yleisiin tauteihin, kuten sydän- ja verisuonitautiin tai diabetekseen, voidaan lähitulevaisuudessa arvioida DNA-analyysin avulla. Tieto riskistä sairastua auttaa taudin varhaiseen hoitoon ja ennalta ehkäisyyn. Tiedot hankittujen mutaatioiden osuudesta syövän kehittymiseen lisääntyvät; DNA-analyysien käyttömahdollisuudet syövän ennustamiseen ja hoidon seurantaan myös lisääntyvät. DNA:n kemiallinen rakenne on samankaltainen kaikissa organismeissa, joten samoja menetelmiä voidaan käyttää bakteerien ja virusten DNA:n analysoimiseksi infektiotaudeissa. DNA-diagnostiikalla onkin suuret mahdollisuudet terveyden edistämiseksi laajassa mittakaavassa. Tämän potentiaalin käytännön hyödyntäminen edellyttää entistä tehokkaampien ja taloudellisempien DNA-testien kehittämistä.

Aiheesta enemmän:

Syvänen, A-C. PCR-menetelmä yksinkertaistaa geneettistä tutkimusta ja diagnostiikkaa. Solubiologi 2:77-82, 1991.

Syvänen, A-C. Vain pieni pätkä DNA:ta: Mysteerit ratkeavat. Tiede 2000 5:46-49, 1992.

Syvänen, A-C. Uusi työkalu tieteelle. Tiede 2000 5:50-51, 1991.

Ann-Christine Syvänen, KTL

Aineistoa lainattaessa lähde mainittava!