Elintarvikkeiden terveyttä uhkaavat riskit ovat luonteeltaan mikrobiologisia, kemiallisten aineiden altistukseen liittyviä tai ravintoaineiden liikasaannin riskejä. Elintarvikkeiden mikrobiologiseen tautiriskiin liittyvät epidemiat selvitetään THL:n ja EVIRAn yhteistyöllä. Myös kemiallisten aineiden riskinarviointi ja ravintoaineiden liikasaannin riskinarviointi toteutetaan EVIRAn, THL:n ja muiden viranomaisten yhteistyönä.
Pohjoisen alueen asukkaiden seerumin D-vitamiinitasot ovat alhaiset. Saannin lisäämiseksi tehostettiin elintarvikkeiden vitaminointia (vitaminoinnin valvonta www.evira.fi). Maitoon alettiin lisätä D-vitamiinia vuonna 2003 ja ravintorasvojen vitaminointitasoa nostettiin. Uuden vitaminointitason vaikutusta seurattiin ja sen todettiin parantavan väestön D-vitamiinitilaa (Hirvonen ym. 2004 Kansanterveyslaitoksen julkaisuja B19, Hirvonen ym. Eur J Nutr 2007;46:264–70, Lamberg-Allardt ym. D-vitamiinitilanteen seurantatutkimus. STM:n julkaisuja 9/2006). Lapsille ja nuorille sekä odottaville ja imettäville naisille annettiin vuonna 2011 lisäksi suositus käyttää D-vitamiinivalmistetta (lue asiasta lisää täältä).