Virologiset ja immunologiset yksiköt

Norovirukset ja muut suolistovirukset

Ihmisen kalikiviruksiin kuuluvat norovirukset ovat yleisimpiä ripulitautien ja ruokamyrkytysepidemioiden aiheuttajia. Infektion aikana noroviruksia erittyy runsaasti sairastuneen henkilön ulosteisiin. Virukset ovat kestäviä ja erittäin herkästi tarttuvia. Lisäksi tartuntaan riittää hyvin pieni virusmäärä. Todennäköisyys saada tartunta yhdestä viruspartikkelista on noin 0.5. Tartunta tapahtuu yleensä viruksilla saastuneen veden, elintarvikkeen tai kosketuspinnan välityksellä. Myös suoraan henkilöstä toiseen tapahtuva tartunta on mahdollinen ja tällaiset tartunnat ovat yleistyneet viime vuosien aikana.Vaikka noroviruksen aiheuttama oksetus-ripulitauti paranee yleensä 1-2 vuorokauden kuluessa, jatkuu viruksen eritys ulosteisiin pitkän aikaa, jopa useita viikkoja.   Lisäksi, ulosteisiin eritettävät virusmäärät, ja siten myös tartuttavuus, ovat suurimmillaan vasta oireiden mentyä, noin 4-5 vrk:n kuluttua tartunnasta.

Norovirukset jaetaan geneettisten ominaisuuksiensa perusteella viiteen genoryhmään, jotka edelleen jakautuvat noin 40 genotyyppiin. Ihmisiä infektoivia viruksia löytyy genoryhmistä GI, II ja IV. Kaksi jälkimmäistä genoryhmää sisältää myös eläimiä infektoivia noroviruksia. Genotyyppi GII.4 on hallinnut maailmaa 1990-luvun puolivälistä alkaen eli koko sen ajan kun genotyypitystä on tehty. Uusia genotyyppejä ilmaantuu noin 3-6 vuoden välein ja ne leviävät influenssavirusten lailla pandemian tavoin ympäri maailman. Uuden variantin ilmaantuessa, vanha häviää pois. Se, mistä uudet variantit tulevat on hämärän peitossa. On mahdollista, että uusia virusvariantteja syntyy rekombinaation tuloksena kun sama yksilö infektoituu samanaikaisesti kahdella eri noroviruksella. Koska sian ulosteista on löydetty ihmisen GII.4 genotyyppiä muistuttavia viruksia, ja sian on todettu infektoituvan ihmisen noroviruksella koe-olosuhteissa, on mahdollista, että uudet variantit syntyvät siassa.

Suolistovirusyksikkö seuraa ihmisissä tautia aiheuttavien epideemisten norovirusten molekyyliepidemiologiaa karakterisoimalla potilasnäytteistä eristettyjä noroviruksia niiden alkuperän selvittämiseksi. Sekvenssianalyysien avulla pyrimme myös ymmärtämään uusien genotyyppien syntyhistoriaa, tautiassosiaatiota ja viruskantojen fenotyyppisten ominaisuuksien (ilmiasun) geneettistä määräytymistä.

Norovirusten lisäksi suolistoinfektioita aiheuttavat lapsilla yleinen rotavirus, sekä sapo- ja astrovirukset.


Julkaisuja

Maunula L, Klemola P, Kauppinen A, Söderberg K, Nguyen T, Pitkänen T, Kaijalainen S, Simonen M, Miettinen I.T, Lappalainen M, Laine J, Vuento R, Kuusi M, Roivainen M. Enteric viruses in a large waterborne outbreak of acute gastroenteritis in Finland. Food and Environm Virol, 1:31-36, 2009.