Avdelningen för barn- och ungdomshälsa (LNTO) genererar ny kunskap om frågor som påverkar barns och ungdomars hälsa samt förmedlar forskningsbaserad kunskap till kommunerna. Avdelningen ger rikstäckande anvisningar för främjande av barns och ungdomars hälsa med speciell inriktning på rådgivningssystemet och skolhälsovården.
Till avdelningens ansvarsområde hör den riksomfattande screeningen för sådana smittsamma sjukdomar hos väntande mödrar som medför risk för moderns och barnets hälsa. I frågor som gäller bland annat kost och nutrition, tobak och alkohol, förebyggande av övervikt, vaccinationer, smittskydd och hygien samt barns och ungdomars mentala hälsa samarbetar avdelningen med experter på Folkhälsoinstitutet övriga avdelningar.
Avdelningen inleder sin verksamhet år 2007. Under detta år kommer man att utveckla avdelningens arbete inom ramen för Folkhälsoinstitutet och som en del av det omfattande samarbete på det nationella planet som verksamheten förutsätter.