Publication Catalogue

Publications of the Department of Bacterial and Inflammatory Diseases 2007

A. Original articles and reviews

  1. Ankelo M, Kleimola V, Simell S, Simell O, Knip M, Jokisalo E, Tarkia M, Westerlund A, He Q, Viander M, Ilonen J, Hinkkanen AE: Antibody responses to deamidated gliadin peptide show high specificity and parallel antibodies to tissue transglutaminase in developing coeliac disease. Clin Exp Immunol 2007;150:285-293.
  2. Bour S, Prevot D, Guigne C, Stolen C, Jalkanen S, Valet P, Carpene C: Semicarbazide-sensitive amine oxidase substrates fail to induce insulin-like effects in fat cells from AOC3 knockout mice. Journal of Neural Transmission 2007;114:829-833.
  3. Cookson BD, Robinson DA, Monk AB, Murchan S, Deplano A, de Ryck R, Struelens MJ, Scheel C, Fussing V, Salmenlinna S, Vuopio-Varkila J, Cuny C, Witte W, Tassios PT, Legakis NJ, van Leeuwen W, van Belkum A, Vindel A, Garaizar J, Haeggman S, Olsson-Liljequist B, Ransjo U, Muller-Premru M, Hryniewicz W, Rossney A, Short BD, Thomas J, Enright MC: Evaluation of Molecular Typing Methods in Characterizing a European Collection of Epidemic Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Strains: the HARMONY Collection. J Clin Microbiol 2007;45:1830-1837.
  4. Edelman K, He Q, Mäkinen J, Sahlberg A, Haanperä M, Schuerman L, Wolter J, Mertsola J: Immunity to Pertussis 5 Years after Booster Immunization during Adolescence. Clin Infect Dis 2007;44:1271-1277.
  5. Elomaa A, Advani A, Donnelly D, Antila M, Mertsola J, He Q, Hallander H: Population dynamics of Bordetella pertussis in Finland and Sweden, neighbouring countries with different vaccination histories. Vaccine 2007;25:918-926.
  6. Emberland K, Ethelberg S, Kuusi M, Vold L, Jensvoll L, Lindstedt B, Nygård K, Kjelso C, Torpdahl M, Sorensen G, Jensen T, Lukinmaa S, Niskanen T, Kapperud G: Outbreak of Salmonella Weltevreden infections in Norway, Danmark and Finland associated with alfalfa sprouts, July-October 2007. EuroSurveillance 2007;12.
  7. Feng PCH, Monday SR, Lacher DW, Allison L, Siitonen A, Keys C, Eklund M, Nagano H, Karch H, Keen J, Whittam TS: Genetic diversity among clonal lineages within Escherichia coli 0157 : H7 stepwise evolutionary model. Emerging Infectious Diseases 2007;13:1701-1706.
  8. Goossens H, Ferech M, Coenen S, Stephens P, the European Surveillance of Antimicrobial Consumption Proje: Comparison of Outpatient Systemic Antibacterial Use in 2004 in the United States and 27 European Countries. Clin Infect Dis 2007;44:1091-1095.
  9. Haanperä M, Jalava J, Huovinen P, Meurman O, Rantakokko-Jalava K: Identification of Alpha-Hemolytic Streptococci by Pyrosequencing the 16S rRNA Gene and by Use of VITEK 2. J Clin Microbiol 2007;45:762-770.
  10. Hallander H, Advani A, Riffelmann M, von König CHW, Caro V, Guiso N, Mooi FR, Gzyl A, Kaltoft MS, Fry NK, Mertsola J, He Q: Bordetella pertussis Strains Circulating in Europe in 1999 to 2004 as Determined by Pulsed-Field Gel Electrophoresis. J Clin Microbiol 2007;45:3257-3262.
  11. Haukka K, Siitonen A: Emerging resistance to newer antimicrobial agents among Shigellaisolated from Finnish foreign travellers. Epidemiol Infect 2007.
  12. Hautala T, Ikäheimo I, Husu H, Saily M, Siitonen T, Koistinen P, Vuopio-Varkila J, Koskela M, Kujala P: A cluster of Candida krusei infections in a haematological unit. BMC Infectious Diseases 2007(Aug 22):7.
  13. Heikkinen E, Kallonen T, Saarinen L, Sara R, King AJ, Mooi FR, Soini JT, Mertsola J, He Q: Comparative Genomics of Bordetella pertussis Reveals Progressive Gene Loss in Finnish Strains. PLoS ONE 2007;2:e904.
  14. Heinikainen S, Pohjanvirta T, Eklund M, Siitonen A, Pelkonen S: Tracing Shigatoxigenic Escherichia coli O103, O145, and O174 infections from farm residents to cattle. J Clin Microbiol 2007;45:3817-3820.
  15. Hijnen M, He Q, Schepp R, van Gageldonk P, Mertsola J, Mooi FR, Berbers GAM: Antibody responses to defined regions of the Bordetella pertussis virulence factor pertactin. Scand J Infect Dis 2007(oct 10).
  16. Holmén C, Elsheikh E, Christensson M, Liu J, Johansson A, Qureshi AR, Jalkanen S, Sumitran-Holgersson: Anti-Endothelial Cell Autoantibodies Selectively Activate SAPK/JNK Signalling in Wegener's Granulomatosis. J AM SOC NEPHROL 2007;18:2497-2508.
  17. Hänninen A, Nurmela R, Maksimow M, Heino J, Jalkanen S, Kurts C: Islet Beta-Cell-Specitic T Cells Can Use Different Homing Mechanisms to Infiltrate and Destroy Pancreatic Islets. AM J PATHOL 2007;170:240-250.
  18. Jalkanen S, Karikoski M, Mercier N, Koskinen K, Henttinen T, Elima K, Salmivirta K, Salmi M: The oxidase activity of vascular adhesion protein-1 (VAP-1) induces endothelial E- and P-selectins and leukocyte binding. Blood 2007;110:1864-1870.
  19. Karden-Lilja M, Ibrahem S, Vuopio-Varkila J, Salmenlinna S, Lyytikäinen O, Siira L, Virolainen A: Panton-Valentine leukocidin genes and staphylococcal chromosomal cassette mec types amongst Finnish community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains, 1997-1999. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007;26:729-733.
  20. Kerttula A, Lyytikäinen O, Kardén-Lilja M, Ibrahem S, Salmenlinna S, Virolainen A, Vuopio-Varkila J: Nationwide Trends in Molecular Epidemiology of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Finland, 1997-2004. BMC Infectious Diseases 2007;7:94.
  21. Kerttula A, Lyytikäinen O, Virolainen A, Finne-Soveri H, Aghte N, Vuopio-Varkila J: Staphylococcus aureus colonization among nursing home residents in a large Finnish nursing home. Scand J Infect Dis 2007;39:996-1001.
  22. Kiss J, Yegutkin GG, Koskinen K, Savunen T, Jalkanen S, Salmi M: IFN-Beta protects from vascular leakage via up-regulation of CD73. Eur J Immunol 2007;37:3334--3338.
  23. Koskinen K, Nevalainen S, Karikoski M, Hänninen A, Jalkanen S, Salmi M: VAP-1-Deficient Mice Display Defects in Mucosal Immunity and Antimicrobial Responses: Implications for Antiadhesive Applications. J Immunol 2007;179:6160-6168.
  24. Kuusi M, Eklund M, Siitonen A, Virkki M, Tarkka E, Häkkinen P, Mäkelä R: Prolonged shedding of shiga toxin-producing Escherichia coli. Pediatr Infect Dis J 2007;26:279.
  25. Könönen E, Bryk A, Niemi P, Kanervo-Nordström A: Antimicrobial susceptibilities of Peptostreptococcus anaerobius and the newly described Peptostreptococcus stomatis isolated from various human sources. Antimicrob Agents Chemother 2007;51:2205-2207.
  26. Könönen E, Paju S, Pussinen PJ, Hyvönen M, Di TP, Suominen-Taipale L, Knuuttila M: Population-based study on salivary carriage of periodontal pathogens in adults. J Clin Microbiol 2007;45:1389-1392.
  27. Lindgren M, Jalava J, Rantakokko-Jalava K, Meurman O: In vitro susceptibility of viridans group streptococci isolated from blood in southwest Finland in 1993-2004. Scand J Infect Dis 2007;39:508-513.
  28. Lyytikäinen O, Mentula S, Könönen E, Kotila S, Tarkka E, Anttila V, Mattila E, Kanerva M, Vaara M, Valtonen V: First isolation of Clostridium difficile PCR ribotype 027 in Finland. EuroSurveillance 2007;12.
  29. Müller HP, Barrieshi-Nusair KM, Könönen E: Repeatability of ultrasonic determination of gingival thickness. Clinical Oral Investigations 2007;11:439-442.
  30. Neal S, Beall B, Ekelund K, Henriques-Normark B, Jasir A, Johnson D, Kaplan E, Lovgren B, Reinert RR, Strep-EURO Study Group, Vuopio-Varkila J: International quality assurance study for characterization of Streptococcus pyogenes. J Clin Microbiol 2007;45:1175-1179.
  31. Nyberg SD, Meurman O, Jalava J, Rantakokko-Jalava K: Evaluation of detection of extended-spectrum beta-lactamases among Escherichia coli and Klebsiella spp. isolates by VITEK 2 AST-N029 compared to the agar dilution and disk diffusion methods. Scand J Infect Dis 2007(Oct 12).
  32. Nyberg SD, Österblad M, Hakanen AJ, Huovinen P, Jalava J, The Finnish study group for antimicrobial resistance: Detection and molecular genetics of extended-spectrum beta-lactamases among cefuroxime- resistant Escherichia coli and Klebsiella spp. isolates from Finland, 2002-2004. Scand J Infect Dis 2007;39:417-424.
  33. Nyberg SD, Österblad M, Hakanen AJ, Löfmark S, Edlund C, Huovinen P, Jalava J: Long-term antimicrobial resistance in Escherichia coli from human intestinal microbiota after administration of clindamycin. Scand J Infect Dis 2007;39:514-520.
  34. Nyström ME, Ranta HM, Peltola JS, Kataja JM: Timing of developmental stages in permanent mandibular teeth of Finns from birth to age 25. ACTA ODONTOL SCAND 2007;65:36-43.
  35. Peters TM, Berghold C, Brown D, Coia J, Dionist AM, Echeita A, Fisher I, Gatto A, Gill N, Green J, Gerner-Smidt P, Heck M, Lederer I, Lukinmaa S, Luzzi I, Maguire C, Prager R, Usera M, Siitonen A, Threlfall E, Torpdahl M, Tchäpe H, Wannet W, Van der Zwaluw W: Relationship of pulsed-field profiles with key phage types of Salmonella enterica serotype Enteritidis in Europe: results of an international multi-centre study. Epidemiol Infect 2007.
  36. Pulkki J, Rautakorpi U, Huikko S, Honkanen P, Klaukka T, Mäkelä M, Palva E, Roine R, Sarkkinen H, Huovinen P, Varonen H, for the MIKSTRA Collaborative Study Group: Recommended and prescribed symptomatic treatment for acute maxillary sinusitis in Finnish primary care. RHINOLOGY 2007;45:197-201.
  37. Rantala M, Nyberg S, Lindgren M, Huovinen P, Jalava J, Skyttä R, Teirilä L, Vainio A, Virolainen-Julkunen A, Kaijalainen T: Molecular epidemiology of telithromycin-resistant pneumococci in Finland. Letter to the editor. Antimicrob Agents Chemother 2007;51:1885-1887.
  38. Ruotsalainen E, Vauhkonen I, Salmenniemi U, Pihlajamäki J, Punnonen K, Kainulainen S, Jalkanen S, Salmi M, Laakso M: Markers of endothelial dysfunction and low-grade inflammation are associated in the offspring of type 2 diabetic subjects. Atherosclerosis 2007(jun 7).
  39. Sahlberg AS, Penttinen MA, Heiskanen KM, Colbert RA, Sistonen L, Granfors K: Evidence That the p38 MAP Kinase Pathway Is Dysregulated in HLA-B27-Expressing Human Monocytic Cells. Arthritis Rheum 2007;56:2652-2662.
  40. Sihvonen L, Lyra C, Fewer DP, Rajaniemi-Wacklin P, Lehtimäki JM, Wahlsten M, Sivonen K: Strains of the cyanobacterial genera Calothrix and Rivularia isolated from the Baltic Sea display cryptic diversity and are distantly related to Gloeotrichia and Tolypothrix. FEMS Microbiology Ecology 2007;61:74-84.
  41. Sivonen K, Halinen K, Sihvonen L, Koskenniemi K, Sinkko H, Rantasärkkä K, Moisander PH, Lyra C: Bacterial diversity and function in the Baltic Sea with an emphasis on cyanobacteria. Ambio 2007;36:180-185.
  42. Tirkkonen T, Pakarinen J, Moisander A, Mäkinen J, Soini H, Ali-Vehmas T: High genetic relatedness among Mycobacterium avium strains isolated from pigs and humans revealed by comparative IS1245 RFLP analysis. Vet Microbiol 2007;125:175-181.
  43. Tuuminen T, Roggenkamp A, Vuopio-Varkila J: Comparison of two bacteremic Asaia bogorensis isolates from Europe. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007;26:523-524.
  44. Tuuminen T, Sorva S, Liippo K, Vasankari T, Soini H, Eriksén-Neuman B, Miettinen A, Seppälä IJ: Feasibility of commercial interferon-gamma-based methods for the diagnosis of latent Mycobacterium tuberculosis infection in Finland, a country of low incidence and high bacille Calmette-Guérin vaccination coverage. Clinical microbiology and infection 2007;13:836-838.
  45. Varhimo E, Savijoki K, Jalava J, Kuipers OP, Varmanen P: Identification of a Novel Streptococcal Gene Cassette Mediating SOS Mutagenesis in Streptococcus uberis. J Bacteriol 2007;189:5210-5222.
  46. Varonen H, Rautakorpi U, Nyberg S, Honkanen PO, Klaukka T, Palva E, Roine R, Sarkkinen H, Mäkelä M, Huovinen P, for the MIKSTRA Collaborative Study Group: Implementing guidelines on acute maxillary sinusitis in general practice - a randomized controlled trial. FAM PRACT 2007;24:201-206.
  47. Yegutkin GG, Samburski SS, Mortensen SP, Jalkanen S, González-Alonso J: Intravascular ADP and soluble nucleotidases contribute to acute prothrombotic state during vigorous exercise in humans. J PHYSIOL (LOND) 2007;579:553-564.

B. Original articles and reviews published in domestic languages

  1. Jalava J: Ihmisen normaali mikrobisto ja terveys. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007;8:4-5.
  2. Kotilanen H, Nohynek H, Jalava K, Siitonen A, Kuusi M, Ruutu P, Murtonen M, Skogberg K: Matkailuun liittyvän lavantaudin eli Salmonella Typhi – infektion riskinarviointi ja torjuntatoimet. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(2):23-23.
  3. Kuusi M, Siitonen A: Kotimaiset kampylobakteeri- ja salmonellatartunnat lisääntyvät kesäkuukausina. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007;-1:14-15.
  4. Könönen E: Parodontiitti – suun yleisin terveysongelma aikuisilla. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(10):14-15.
  5. Lyytikäinen O, Turunen H, Rasinperä M, Könönen E, Vuento R, Keskimäki I: Clostridium difficile -infektiot lisääntyneet iäkkäillä (Clostridium difficile infection in patients discharged from Finnish health care facilities in 1996-2004). Suom Lääkäril 2007;32:2753-2757.
  6. Mentula S, Rasinperä M, Lyytikäinen O, Könönen E: Clostridium difficile -diagnostiikka Suomessa. Moodi 2007(4):140-142.
  7. Rantala M, Siira L, Virolainen-Julkunen A, Lyytikäinen O, Kaijalainen T, Jalava J, Hakanen A, Huovinen P: Invasiivisten pneumokokkien mikrobilääkeherkkyys heikkenee Suomessa. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(8):16-16.
  8. Salmi M: Valkosolujen liikenne mikrobitaudeissa. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007;8:6-7.
  9. Siitonen A, Sihvonen L, Pitkänen T, Zacheus O: Uimiseen liittyvät infektioriskit. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(1):20-21.

C. Textbooks and chapters in textbooks, reports and proceedings

  1. Airas L, Niemelä J, Yegutkin G, Jalkanen S: Mechanism of Action of IFN-Beta in the Treatment of Multiple Sclerosis: A Special Reference to CD73 and Adenosine. In: Gershwin ME, Shoenfeld Y ed. Autoimmunity, Part B Novel Applications of Basic Research. New York: The New York Academy of Life Sciences, 2007:641-648. (Annals of the New York Academy of Sciences Volume 1110/2007).
  2. Hovi T, Huovinen P, Kilpi T, Ruutu P: National Public Health Institute, Infectious Disease Surveillance, Control and Research 2000–2007, Background Material for the International Evaluation. Helsinki: National Public Health Institute, 2007. (Publications of the National Public Health Institute B 16/2007).
  3. Huovinen P: 61 infektioaiheista kappaletta. In: Hannuskela M, Huttunen M, Huovinen P, Jalanko H, Mustajoki P, Saarelma O, Tiitinen A ed. Lääkärikirja Duodecim. nettikirja: Kustannus Oy Duodecim, 2007. (www.terveyskirjasto.fi).
  4. Huovinen P: Bakteerit ja virukset - ystäviä vai vihollisia. In: Huttunen J, Mustajoki P ed. Elämä pelissä. Jyväskylä: Kustannus Oy Duodecim, 2007:107-113.
  5. Huovinen P, Matilainen I: Heippa - täällä bakteeri! WSOY, 2007. 64 p.
  6. Jalava K, Kuusi M, Siitonen A, Ruutu P: Toimenpideohje EHEC-tartuntojen ehkäisemiseksi. Helsinki: Kansanterveyslaitos, 2007. (Publications of the National Public Health Institute C 1/2007).
  7. Jalava K, Kuusi M, Siitonen A, Ruutu P: Åtgärdsanvisning för att förhindra EHEC-smitta. Helsingfors: Folkhälsoinstitutet, 2007. (Publications of the National Public Health Institute C 3/2007).
  8. Jalkanen S, Salmi M: Lymphocytes: Recirculation. In: Encyclopedia of Life Sciences. John Wiley & Sons, 2007:1-7.
  9. Jokiranta S, Huovinen P: Mikrobilääkeresistenssi ja sen torjunta avoterveydenhuollossa. In: Hakulinen E, Huotari K, Marjasuo P, Päykkönen S, Savonen L, Vilpo J ed. Laboratoriokäsikirja 2008-2009. Keuruu: Yhtyneet Laboratoriot, 2007:422-427.
  10. Kilpi T, Salo H, Salminen M, Kuusi M, Lyytikäinen O, Siitonen A, Huovinen P, Eskola J: Tarttuvien tautien torjunnan kustannusvaikuttavuus. In: Terveydenhuollon menojen hillintä; rahoitusjärjestelmän ja ennaltaehkäisyn merkitys. Helsinki: altioneuvoston kanslia, 2007:98-111. (Valtioneuvoston kanslian julkaisusarja 4/2007/2007).
  11. Kuusi M, Jalava K, Siitonen A, Ruutu P: Toimenpideohje salmonellatartuntojen ehkäisemiseksi. Helsinki: Kansanterveyslaitos, 2007. (Publications of the National Public Health Institute C 2/2007).
  12. Kuusi M, Jalava K, Siitonen A, Ruutu P: Åtgärdsanvisning för att förhindra salmonellasmitta. Helsingfors: Folkhälsoinstitutet, 2007. (Publications of the National Public Health Institute C 4/2007).
  13. Könönen E, Wade WG: Propionibacterium, Lactobacillus, Actinomyces, and other non-spore-forming anaerobic gram-positive rods. In: Murray PR ed. Manual of Clinical Microbiology, 9th edition. Washington: American Society for Microbiology, 2007:872-888.
  14. Mooi FR, He Q, Guiso N: Phylogeny, Evolution, and Epidemiology of Bordetellae. In: Bordetella Molecular Microbiology. Great Britain: horizon bioscience, 2007:17-45.
  15. Niskanen T, Johansson T, Siitonen A, Kuusi M: Ruokamyrkytykset Suomessa 2006. Helsinki: Evira, 2007. 62 p. (Elintarviketurvallisuusviraston julkaisuja 21/2007/2007).
  16. Nohynek H, Siitonen A: Kolera. In: Nohynek H, Pekkanen E, Turtiainen P, Kainulainen K ed. Matkailijan terveysopas 2007. Helsinki: Duodecim, 2007:121-123.
  17. Nohynek H, Siitonen A: Lavantauti. In: Nohynek H, Pekkanen E, Turtianen P, Kainulainen K ed. Matkailijan terveysopas 2007. Helsinki: Duodecim, 2007:124-126.
  18. Salmi M, Jalkanen S: Vascular adhesion protein-1 (VAP-1). In: Ley K ed. Adhesion Molecules: Function and Inhibition. Basel: Birkhäuser Verlag AG, 2007:237-251.

D. Other publications

  1. Huovinen P: Enintään kaksi annosta päivässä ja seitsemän viikossa (kolumni). 2007. (Turun Sanomat 1.7.2007).
  2. Huovinen P: Keski-ikäisten naisten taakka. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(9):2.
  3. Huovinen P: Maailma varautuu influenssapandemiaan. 2007. (Humaliston apteekin 100-vuotisjuhlajulkaisu, Turku).
  4. Huovinen P: Miten terveysmenojen kasvua hillitään? 2007. (Turun Sanomat 2.3.2007).
  5. Huovinen P: Miten torjua masennusta? 2007. (Turun Sanomat Tietopulssi 9.9.2007).
  6. Huovinen P: Onneksi on tutkittua tietoa. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(5-6):2.
  7. Huovinen P: Onnellisuutta etsimässä. 2007. (Turun Sanomat Tietopulssi 25.2.2007).
  8. Huovinen P: Tavoitteena ymmärtävä kumppanuus. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(8):2.
  9. Huovinen P: Vaikuttavampaan suuntaan. Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(7):2.
  10. Huovinen P: Voiko lihomisen pysäyttää? Kansanterveys - the Bulletin of National Public Health Institute of Finland 2007(10):2.
  11. Siitonen A: Ruokamyrkytysten jälkiä seurattava. 2007. (Helsingin Sanomat 28.6.2007).
  12. Tohila H, Huovinen P: Vanhuuden varjossa. 2007. (Uudenkaupungin Sanomat 9.1.2007).

E. Theses

  1. Kerttula AM: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Finland: recent changes in the epidemiology, long-term facility aspects, and phenotypic and molecular detection of isolates [Dissertation]. Helsinki: National Public Health Institute, University of Helsinki, 2007. (Publications of the National Public Health Institute A 16/2007).
  2. Sarkonen N: Oral Actinomyces species in health and disease: Identification, occurrence and importance of earl colonization [Dissertattion]. Helsinki: National Public Health Institute, 2007. (Publications of the National Public Health Institute A 8/2007).